Ion torrent-sekvensering – Snart i varje hem?

I början av 90-talet började man arbetet med att kartlägga hela det mänskliga genomet. Man beräknade att arbetet skulle kosta tre miljarder dollar och ta 15 år. Det tog 13 år (1990-2003). Jag vet inte hur stor kostnaderna blev till slut men gissar att det hamnade runt omkring det beräknade (uppdatering 10 aug: Snubblade över siffran: 2,7 miljader dollar). Hela historien är värd att återberätta och jag kommer nog göra det någon dag.

Idag kan man sekvensera ett helt mänskligt genom på ungefär en vecka till en kostnad av 10,000 dollar. Men priset faller snabbt och tekniken utvecklas ännu snabbare. En av dessa tekniker som banar vägen för billig och snabb sekvensering av hela genom är Ion torrent-tekniken. Nyligen presenterade företaget med samma namn sekvenseringsmaskinen Personal Genome Machine (PGM) som är den första sekvenseringsmaskinen med potential att köpas och användas av hemmafixande biologer (så kallade DIY-biologer (Do It Yourself)). Fördelarna med maskinen är att den är liten, kompakt och snabb. Nackdelarna är att den kostar närmare 50,000 dollar och har en liten kapacitet jämfört med övriga andra generationers sekvenserare (den duger inte för att sekvensera ett mänskligt genom). Men i och med att Moores lag även gäller inom sekvensering så är det en tidsfråga innan dessa maskiner börjar hamna hos DIY-biologer. Två till fyra år skulle jag gissa om utvecklingstakten håller i sig.


Ion torrent personal genome machine

Hur man inte ska ljuga

Svenska Dagbladet publicerade igår en artikel, baserat på en Wikileaksläcka, om hur svenska regeringen representerade av Carl Bildt och Tobias Billström i ett möte med en amerikansk ambassadör ska ha på olämpliga sätt uttryckt önskemål om att begränsa invandringen från Irak till Sverige.

När SVT får tag i Tobias Billström för en kommentar så märks det ganska snabbt att regeringen lagt upp en strategi för att inte låta problemet spinna iväg åt fel håll. Billström har nämligen, bokstavligt talat, bara en kommentar och han upprepar den över 15 gånger under 3 minuter och 27 sekunder. Klippet finns nedan. Det är helt brutalt.

Påminner väldigt exakt om de första scenerna ur filmen The life of others.

Man bara vet att Billström (regeringen) har gjort nåt dumt, något riktigt, riktigt dumt.

Tankar kring valresultatet

Sverigedemokraterna i riksdagen. Plöstligt pratar alla om invandrarna. Nu är det lika populärt att vara invandrare som det var populärt att vara svart precis när Obama röstades till president. Undrar om svensk svenskarna kommer titta på en med skammen i blicken imorgon? Typ “Förlåt, jag gjorde allt jag kunde…” Jag antar väl att jag tittar tillbaka med blicken “Jo, jag vet. Det är ingen fara. Du har inte gjort nåt fel”.

Men det bästa vore väl om vi bara såg på varandra som vi gjorde innan valresultatet presenterades? För jag vill inte att du ska tycka synd om mig och jag antar att du inte vill känna dig skyldig för valresultatet? Japp, det blir bäst så. Då kör vi på det.

För övrigt, bästa sättet att bemöta SD hade inte varit genom sakliga debatter. Det hade troligen gjort lite eller ingen skillnad. Det är sällan informationsbrist som är problemet. Att utgå ifrån att endast sakliga argumet hade varit tillräckligt för att bemöta SD är att utgå ifrån att människor är rent logiska varelser. Det är vi inte. Vi är nog mer känslovarelser än logiska varelser. Att dra upp massa statistik för en person som känner en känsla av hat mot en folkgrupp (eller vilken känsla som helst för vad som helst) kommer inte ändra den känslan. Tvärtom kommer den känslan troligen att växa ännu mer (prova att säga till en person som är förbannad över en viss grej att han har fel och se hur han reagerar på det).

Bästa sättet att bemöta SD, men inte det enda sättet, hade varit genom att: respektera deras åsikt och inte säga att de har fel, ha förståelse för varför de tycker som de gör, se saker från deras synvinkel. Och sist men inte minst, bygg bryggor mellan människor från olika kulturer. Kompisar vill sällan varandra ont.

Jag skulle personligen inte ha nåt emot att ha nåt emot att ha sverigedemokrater som vänner. Vänner som vänner.

Tråkigt med Piratpartiet också, men väntat. Men PP är kämpar så vi kommer kämpa på 🙂 Om fyra år är det dessutom Europaparlamentsval och riksdagsval under samma år. Alltså nästan ett helt år av aktiv valrörelse. Får se om det har positiv eller negativ effekt på varandra.

Dags att sova. Det är en vardag imorgon. Och kom ihåg, vare sig du stöter en invandrare, en sverigedemokrat eller en etnisk svenska under din vardag så finns det nästan alltid en person där under någonstans som egentligen bara vill bli bemöt som en människa.

Diskussioner om att skapa patentpool

Genom att starta en patentpool hoppas det internationella organet Unitaid att tillgången på läkemedel mot hiv ska öka i låginkomstländer. Diskussioner om poolen har pågå under flera år och under nästa kan den bli verklighet. Men det hänger på att industrin är med.

Diskussionerna har pågått länge men har tagit fart senaste veckorna. Jag tvivlar dock starkt på att det kommer resultera i något som ger långsiktigt goda resultat. Känns väldigt mycket som STIM-förslaget att ena bredbandleverantörerna kring en frivillig bredbandsskatt. Jättestort intresse rapporterades i början, men det var dödfött. Känner samma vibbar här.

7,2 miljarder euro är bara siffror

EU:s stats- och regeringschefer lovar att under de kommande tre åren ställa totalt 7,2 miljarder euro till förfogande för att hjälpa fattiga länder att klara av den globala uppvärmningen. De hoppas på så sätt få ökat stöd för ett nytt klimatavtal i Köpenhamn /…/ Stödet ska bland annat gå till att skydda kuster, bevara skogar, odla nya grödor och byta från fossil till utsläppssnål energi.

Hur ska u-länderna “byta från fossil till utsläppssnål energi” när i-länderna överhuvudtaget inte vill nämna tekniköverföring/patent? Nej, 7,2 miljarder årligen de kommande tre åren, utspritt på alla sorters åtgärder, är på tok för lite för att u-länderna ska köpa teknik från i-länderna.

Om man inte börjar prata tekniköverföring och patent och hur det ska gå till i praktiken så kommer 7,2 miljarder euro inte vara så mycket mer än en imponerande siffra (trots att det är på tok för lite) och med tanke på gårdagens kollapsade diskussioner kring tekniköverföring så finns det inte mycket att hoppas på.