Free the Mind

Archive for the ‘Ion torrent’ tag

Ion torrent-sekvensering – Snart i varje hem?

with one comment

I början av 90-talet började man arbetet med att kartlägga hela det mänskliga genomet. Man beräknade att arbetet skulle kosta tre miljarder dollar och ta 15 år. Det tog 13 år (1990-2003). Jag vet inte hur stor kostnaderna blev till slut men gissar att det hamnade runt omkring det beräknade (uppdatering 10 aug: Snubblade över siffran: 2,7 miljader dollar). Hela historien är värd att återberätta och jag kommer nog göra det någon dag.

Idag kan man sekvensera ett helt mänskligt genom på ungefär en vecka till en kostnad av 10,000 dollar. Men priset faller snabbt och tekniken utvecklas ännu snabbare. En av dessa tekniker som banar vägen för billig och snabb sekvensering av hela genom är Ion torrent-tekniken. Nyligen presenterade företaget med samma namn sekvenseringsmaskinen Personal Genome Machine (PGM) som är den första sekvenseringsmaskinen med potential att köpas och användas av hemmafixande biologer (så kallade DIY-biologer (Do It Yourself)). Fördelarna med maskinen är att den är liten, kompakt och snabb. Nackdelarna är att den kostar närmare 50,000 dollar och har en liten kapacitet jämfört med övriga andra generationers sekvenserare (den duger inte för att sekvensera ett mänskligt genom). Men i och med att Moores lag även gäller inom sekvensering så är det en tidsfråga innan dessa maskiner börjar hamna hos DIY-biologer. Två till fyra år skulle jag gissa om utvecklingstakten håller i sig.


Ion torrent personal genome machine

Written by floodis

January 23rd, 2011 at 12:27 am